匯總納稅新辦法對匯算清繳有何影響
2012年底，《國家稅務(wù)總局關(guān)于〈跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法〉的公告》（國家稅務(wù)總局公告2012年第57號，以下簡稱新辦法） 發(fā)布。新辦法廢止了自2008年以來執(zhí)行的《國家稅務(wù)總局關(guān)于跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理暫行辦法》（國稅發(fā)〔2008〕28號，以下簡稱28 號文件），對跨地區(qū)總分機構(gòu)稅款分配和繳納的方法作出了修改，納稅人應(yīng)特別關(guān)注。
????預(yù)繳的改變
????28號文件第二 十三條規(guī)定，總機構(gòu)應(yīng)按照以前年度（1月~6月按上上年度，7月~12月按上年度）分支機構(gòu)的經(jīng)營收入、職工工資和資產(chǎn)總額3個因素計算各分支機構(gòu)應(yīng)分?jǐn)?所得稅款的比例?？倷C構(gòu)計算分配稅款的比例，上半年和下半年是不一樣的，上半年以上上年度的數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)，下半年以上年度的數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)，導(dǎo)致同一納稅年度分 配比例不一致。
????新辦法第十五條規(guī)定，總機構(gòu)應(yīng)按照上年度分支機構(gòu)的營業(yè)收入、職工薪酬和資產(chǎn)總額3個因素計算各分支機構(gòu)分?jǐn)偹枚惪畹谋壤?，不再區(qū)分上上年度和上年度，在同一納稅年度內(nèi)分配比例一致，簡化了計算方法。
????匯算清繳的改變
????28 號文件第二十二條規(guī)定，總機構(gòu)在年度終了后5個月內(nèi)，應(yīng)依照法律、法規(guī)和其他有關(guān)規(guī)定進(jìn)行匯總納稅企業(yè)的所得稅年度匯算清繳。各分支機構(gòu)不進(jìn)行企業(yè)所得稅 匯算清繳。當(dāng)年應(yīng)補繳的所得稅款，由總機構(gòu)繳入中央國庫。當(dāng)年多繳的所得稅款，由總機構(gòu)所在地主管稅務(wù)機關(guān)開具稅收收入退還書等憑證，按規(guī)定程序從中央國 庫辦理退庫。在匯算清繳時，稅款的多退少補，均由總機構(gòu)來完成，各分支機構(gòu)不用進(jìn)行匯算清繳。
????新辦法第十條規(guī)定，匯總納稅企業(yè)應(yīng)當(dāng) 自年度終了之日起5個月內(nèi)，由總機構(gòu)匯總計算企業(yè)年度應(yīng)納所得稅額，扣除總機構(gòu)和各分支機構(gòu)已預(yù)繳的稅款，計算出應(yīng)繳應(yīng)退稅款，按照本辦法規(guī)定的稅款分?jǐn)?方法計算總機構(gòu)和分支機構(gòu)的企業(yè)所得稅應(yīng)繳應(yīng)退稅款，分別由總機構(gòu)和分支機構(gòu)就地辦理稅款繳庫或退庫。這是新辦法的一個重大變化，在匯算清繳時，多退少補 的稅款須在總分機構(gòu)之間分?jǐn)?，各分支機構(gòu)也要參與匯算清繳，解決了總機構(gòu)所在地稅務(wù)機關(guān)補退稅壓力過大的問題。
????查補稅款的規(guī)定
????28 號文件對總分機構(gòu)查補的稅款沒有規(guī)定，查補的稅款是否還要進(jìn)行分配，各地執(zhí)行不一。新辦法第二十七條第三款規(guī)定，總機構(gòu)應(yīng)將查補所得稅款（包括滯納金、罰 款，下同）的50%按照本辦法第十五條規(guī)定計算的分?jǐn)偙壤?，分?jǐn)偨o各分支機構(gòu)（不包括本辦法第五條規(guī)定的分支機構(gòu)）繳納，各分支機構(gòu)根據(jù)分?jǐn)偛檠a稅款就地 辦理繳庫。第二十七條第四款規(guī)定，二級分支機構(gòu)應(yīng)將查補所得稅款的50%分?jǐn)偨o總機構(gòu)繳納，其中25%就地辦理繳庫，25%就地全額繳入中央國庫；50% 分?jǐn)偨o該二級分支機構(gòu)就地辦理繳庫。
????對于總機構(gòu)查補的稅款，按照比例分?jǐn)偨o各分支機構(gòu)；對于分支機構(gòu)的查補稅款，50%應(yīng)分配給總機構(gòu)繳納，50%分配給被檢查的分支機構(gòu)繳納，沒有被檢查的其他分支機構(gòu)不參與查補稅款的分配。
????舉例
????（一）28號文件施行時
????1.上半年預(yù)繳時，根據(jù)上上年度的三因素數(shù)據(jù)：
????假設(shè)總機構(gòu)201X年度第一季度應(yīng)納所得稅額為1000萬元，那么
????總機構(gòu)需繳納1000×50%＝500（萬元）。
????三個分支機構(gòu)分?jǐn)?000×50%＝500（萬元）。
????分支機構(gòu)一分?jǐn)偙壤秊?00÷600×0.35＋100÷600×0.35＋100÷600×0.3＝0.17。
????分支機構(gòu)二分?jǐn)偙壤秊?00÷600×0.35＋200÷600×0.35＋200÷600×0.3＝0.33。
????分支機構(gòu)三分?jǐn)偙壤秊?00÷600×0.35＋300÷600×0.35＋300÷600×0.3＝0.5。
????分支機構(gòu)一應(yīng)分?jǐn)偟亩愵~為500×0.17＝85（萬元）。
????分支機構(gòu)二應(yīng)分?jǐn)偟亩愵~為500×0.33＝165（萬元）。
????分支機構(gòu)三應(yīng)分?jǐn)偟亩愵~為500×0.5＝250（萬元）。
????2.下半年預(yù)繳時，根據(jù)上年度的三因素數(shù)據(jù)：
????假設(shè)總機構(gòu)201X年度第三季度應(yīng)納所得稅額為1000萬元，那么
????總機構(gòu)需繳納1000×50%＝500（萬元）。
????三家分支機構(gòu)分?jǐn)?000×50%＝500萬元。
????分支機構(gòu)一分?jǐn)偙壤秊?00÷500×0.35＋100÷500×0.35＋100÷500×0.3＝0.2。
????分支機構(gòu)二分?jǐn)偙壤秊?50÷500×0.35＋150÷500×0.35＋150÷500×0.3＝0.3。
????分支機構(gòu)三分?jǐn)偙壤秊?50÷500×0.35＋250÷500×0.35＋250÷500×0.3＝0.5。
????分支機構(gòu)一應(yīng)分?jǐn)偟亩愵~為500×0.2＝100（萬元）。
????分支機構(gòu)二應(yīng)分?jǐn)偟亩愵~為500×0.3＝150（萬元）。
????分支機構(gòu)三應(yīng)分?jǐn)偟亩愵~為500×0.5＝250（萬元）。
????3.匯算清繳時，假設(shè)總分機構(gòu)201X年度應(yīng)納所得稅額為5000萬元，已預(yù)繳4000萬元，應(yīng)補繳1000萬元，由總機構(gòu)在其所在地主管稅務(wù)機關(guān)入庫。
????（二）新辦法施行時
????1.預(yù)繳時不再區(qū)分上上年度和上年度，統(tǒng)一使用上年度數(shù)據(jù)計算，三家分支機構(gòu)全年的分?jǐn)偙壤鶠?.2、0.3、0.5。
????2.匯算清繳時，假該設(shè)總分機構(gòu)應(yīng)補繳稅款1000萬元
????總機構(gòu)需補繳1000×50%＝500（萬元）。
????分支機構(gòu)一需補繳500×0.2＝100（萬元）。
????分支機構(gòu)二需補繳500×0.3＝150（萬元）。
????分支機構(gòu)三需補繳500×0.5＝250（萬元）。
????（三）查補稅款
????1.匯算清繳結(jié)束后，總機構(gòu)主管稅務(wù)機關(guān)對其進(jìn)行了納稅評估，需補繳企業(yè)所得稅20萬元。
????總機構(gòu)需補繳20×50%＝10（萬元）。
????分支機構(gòu)一需補繳10×0.2＝2（萬元）。
????分支機構(gòu)二需補繳10×0.3＝3（萬元）。
????分支機構(gòu)三需補繳10×0.5＝5（萬元）。
????2.匯算清繳結(jié)束后，分支機構(gòu)一主管稅務(wù)機關(guān)對其進(jìn)行了納稅評估，需補繳企業(yè)所得稅10萬元。
????總機構(gòu)需補繳10×50%＝5（萬元）。
????分支機構(gòu)一需補繳10×50%＝5（萬元）。
????需要注意的問題
????新 辦法自2013年1月1日起施行，根據(jù)國家稅務(wù)總局辦公廳發(fā)布的新辦法解讀，匯總納稅企業(yè)在即將開始的2012年度匯算清繳時仍適用28號文件，而不適用 新辦法。但是，在2013年度第一次預(yù)繳時，就應(yīng)按照新辦法執(zhí)行了。若按照28號文件，2013年度第一季度預(yù)繳時，三因素應(yīng)根據(jù)上上年度，即2011年 度的數(shù)據(jù)計算，但按照新辦法，則應(yīng)根據(jù)上年度，即2012年度的數(shù)據(jù)計算，企業(yè)要特別注意。